Tongan lipulla on pitkä historia, joka voidaan tiivistää seuraavilla kohdilla:
- Käyttöönotto vuonna 1866: Tongan lippu otettiin ensimmäisen kerran käyttöön vuonna 1866.
- Virallinen vahvistaminen perustuslaissa: Lippu määriteltiin virallisesti Tongan perustuslaissa 4. marraskuuta 1875.
- Alkuperäinen suunnittelu vuonna 1862: Alun perin lippu suunniteltiin vuonna 1862, ja se muistutti Punaisen Ristin lippua.
- Muutokset välttääkseen sekaannusta: Alkuperäistä suunnittelua muutettiin myöhemmin, jotta vältettäisiin sekaannusta. Uusi suunnittelu sisältää punaisen ristin, joka symboloi Jeesuksen ristiä.
- Perustuslain kieltäytyminen muutoksista: Tongan perustuslain mukaan lippua ei saa koskaan muuttaa, korostaen sen pysyvyyttä ja symbolista merkitystä.
- Armeijan ja laivaston omat liput: Vaikka lippua ei saa muuttaa, maan armeijalla ja laivastolla on omat liput.
Tämä lippu on siis pysynyt muuttumattomana merkittävänä symbolina, heijastaen Tongan rikasta kulttuuria ja historiaa.